Юный герой Джейкоб, оказывается на острове, среди необычных детей.
Воспитанники Мисс Перегрин, дети с талантами левитации, невидимки, телепаты.
Скептицизм героя, который слушал в детстве истории дедушки, об этом месте, рассеивается.
Подросткам предстоит сразиться с невидимым злом. В этом им поможет Джейкоб, ведь у него главная суперспособность.